房屋稅是以附著於土地的各種房屋，及有關增加該房屋使用價值的建築物，為課徵對象，無照違章建築房屋，也不例外；並依房屋實際使用情形分別按不同之稅率課徵。而房屋稅的完納，只是納稅義務的履行，不能據以使違章建築房屋變成合法。
許多民眾以為違章建築房屋，可能隨時會被拆除，就不用申報且不需繳納房屋稅。臺東縣稅務局說明，對於任何地區違章建築房屋在未拆除前，均應依法於房屋建造完成之日起30日內向稅捐稽徵機關申報設立房屋稅籍。若違章建築房屋不予設籍課稅，不僅增加稅籍管理的困難，對合法房屋來說更有失公平，也可能發生反效果，助長違建的情形。
該局特別提醒，房屋如有使用情形變更，應依房屋稅條例第7條規定，自變更之日起30日內向該局申報，以免受罰。如有房屋稅任何疑問，可利用該局服務電話：089-231600分機277、282洽詢。